OSPF允許連續(xù)的網(wǎng)絡和主機集合被組織在一起。這樣一個組，與那些具有到所包括的網(wǎng)絡中任一接口的路由器一起被稱為一個區(qū)域。每一區(qū)域運行一個基本鏈接狀態(tài)路由算法的獨立拷貝。如前所述，這意味著每一區(qū)域有其自身的鏈接狀態(tài)數(shù)據(jù)庫及對應的圖。

一個區(qū)域的拓撲對區(qū)域外是不可見的。相應的，對一指定區(qū)域內(nèi)部路由器來說，區(qū)域外拓撲細節(jié)也是不可知的。與把整個自治系統(tǒng)當作一個單鏈接狀態(tài)域比較而言，這一知識的分離使得協(xié)議可以顯著減少路由選擇數(shù)據(jù)流量。由于區(qū)域的引入，所有路由器具有相同鏈接狀態(tài)數(shù)據(jù)庫這一說法不再正確。路由器實際上對它每一個所連區(qū)域都有一個獨立鏈接狀態(tài)數(shù)據(jù)庫（連接到多個區(qū)域的路由器被稱為區(qū)域邊界路由器）。屬于同一區(qū)域的路由器，對該區(qū)域具有相同的鏈接狀態(tài)數(shù)據(jù)庫。

在自治系統(tǒng)內(nèi)的路由選擇在兩個級別上發(fā)生，這取決于一個包的源和目的地址是否處于相同的區(qū)域中（使用域內(nèi)路由選擇）或者處于的區(qū)域中（使用域間路由）。在域內(nèi)路由選擇時，包僅依靠在域內(nèi)獲得的消息進行路由，不能使用從區(qū)域外獲得的路由選擇信息。這可以保護域內(nèi)路由選擇不受注入的壞路由信息的影響。在3.3 節(jié)中對域間路由進行討論。

一、 自治系統(tǒng)的主干

OSPF主干是特殊的OSPF區(qū)域0（通常寫為區(qū)域0.0.0.0，因為OSPF區(qū)域ID典型的以IP地址格式表示）。OSPF主干總是包含所有區(qū)域邊界路由器。主干負責在非主干區(qū)域間分配路由信息。主干必須連續(xù)。然而，它不需要物理連續(xù)；主干的連接性可以通過虛鏈的配置得以建立和維護。

虛鏈可以在任何具有到相同非主干區(qū)域的接口的路由器上配置。虛鏈同樣屬于主干。協(xié)議把用虛鏈鏈接起來的兩個路由器看作是由點到點主干網(wǎng)絡連接起來。在主干的圖上，這樣兩個路由器有一段弧連接，其代價是這兩個路由器之間的區(qū)域內(nèi)距離。沿虛鏈的路由選擇協(xié)議流量僅使用域內(nèi)路由選擇。

二、域間路由選擇

當在兩個非主干區(qū)域之間進行路由選擇時，使用主干。包走過的路徑可以被劃分為三個連續(xù)段：從源到區(qū)域邊界路由器的域內(nèi)路由，在源和目的區(qū)域之間的主干路徑，然后是另一個到目標的域內(nèi)路徑。算法會找出具有最小代價的相應路徑。以另一種方式來看，域間路由選擇可以看作是一個對自治系統(tǒng)的強制星型配置——主干作為HUB，而非主干區(qū)域作為輪輻。

主干的拓撲指出在區(qū)域間使用的網(wǎng)絡路徑。主干拓撲可以通過添加虛鏈路得到增強。這一方法為系統(tǒng)管理員提供了控制域間流量的方法。

選擇包離開源區(qū)域的正確區(qū)域邊界路由器和選擇通告外部路由的路由器使用相同方法。每一區(qū)域邊界路由器為本區(qū)域匯總到所有處于區(qū)域之外的網(wǎng)絡代價。在SPF樹計算之后，可以通過檢查區(qū)域邊界路由器匯總計算到所有域間目標的路由。