診所管理系統是專門為社區衛生所、鄉鎮門診制作的一款集病案、收費和藥房于一體的管理軟件。該軟件功能包括：基礎設置，病案管理，收費管理，藥房管理和財務管理。 基礎設置為其他模塊做鋪墊，在基礎設置中把一些常用數據設置好，以便其他模塊調用，方便錄入、節省時間，其包括：藥品信息、供藥單位、人員信息和收費項目等；病案管理包括：患者初診登記、患者復診登記、患者查詢和期間患者登記查詢等；收費管理包括：收費登記、患者欠款統計和期間藥品銷售統計等；藥房管理包括：藥品入庫（藥品入庫、期間藥品入庫統計），藥品入庫退貨（藥品入庫退貨、期間藥品退貨統計），藥品庫存（藥品總庫存、藥品庫存明細、藥品缺貨提醒、藥品溢出提醒），藥品有效期管理（已過期藥品、半年內過期藥品、指定天數內過期藥品）；財務管理包括：付供商欠款登記和欠供商款統計。