軟件介紹

SnapGene破解版是一款非常好用的生物分子DNA序列分析軟件。在軟件內(nèi)，你可以通過它來設(shè)計模擬DNA的克隆過程，它可以將這一過程完美的復(fù)現(xiàn)并且還會自動修復(fù)錯誤問題，讓你一次就可以獲得成功！同時還將用戶的每一步操作都具象化、可視化，讓你可以直觀的看到自己的工作進度。

SnapGene破解版還可以將用戶的每一步操作都保留下來，并以圖形歷史的展現(xiàn)方式清晰的將每一個重要步驟的節(jié)點保留，回顧起來更加方便觀看！它受國內(nèi)各大高校以及多個制藥公司的歡迎，有需要的小伙伴快來下載吧！

軟件特色

1、In-Fusion 克隆

Clontech 的 In-Fusion 克隆技術(shù)是創(chuàng)建無縫基因融合的一種非常通用的方法。 SnapGene 是第一個模擬此程序的軟件。 只需選擇您想要融合的 DNA 片段，SnapGene 即可設(shè)計引物。

2、Gibson Assembly？

許多研究人員轉(zhuǎn)向 Gibson 組裝，在不使用限制性酶的情況下將片段插入質(zhì)粒中。待連接的 DNA 片段通過 PCR 擴增以產(chǎn)生重疊的末端。SnapGene 簡化了Gibson組裝反應(yīng)的計劃，并自動化了引物設(shè)計。

3、限制性克隆

SnapGene 獨特的限制克隆界面以干凈的布局顯示您需要的信息。克隆程序的規(guī)劃從來沒有這么簡單過。如果你已經(jīng)知道你想做什么，克隆模擬只需要幾秒鐘。如果克隆過程存在設(shè)計缺陷，則可以在模擬過程中捕獲并糾正錯誤。

4、聚合酶鏈反應(yīng)與誘變

設(shè)計引物后，它們可以用來模擬常規(guī) PCR、重疊延伸 PCR 或誘變。得到的DNA序列文件可立即用于進一步操作。與限制克隆界面一樣，以引物為中心的界面以直觀的方式顯示關(guān)鍵信息。

5、自動保存

SnapGene 最令人驚訝的是它自動記錄了克隆項目中的步驟。每次編輯序列或模擬克隆、PCR 或誘變時，程序都會自動記錄在圖形歷史中。在模擬 DNA 構(gòu)建體的創(chuàng)建之后，您可以使用歷史作為實驗方案。

6、瓊脂糖凝膠電泳

napGene 使用一種先進的算法來創(chuàng)建真實的瓊脂糖凝膠模擬。限制性片段以三種形式顯示:模擬凝膠、數(shù)值列表和序列圖。您可以使用模擬凝膠計劃診斷限制摘要，或?qū)�實際凝膠圖像與預(yù)測模式進行比較。

7、酶位點

SnapGene 以清晰的方式突出限制位點，自動標(biāo)記甲基化阻斷的位點。簡單的控制可以讓你選擇有用的酶組，比如“獨特的切割器”，或者定義自定義酶組和首選供應(yīng)商。信息工具提示提供關(guān)鍵數(shù)據(jù)。“限制酶”窗口顯示了數(shù)百種商用酶的詳細特性。

軟件功能

一、想象

1、DNA可視化

查看DNA序列的多個視圖。

地圖 · 序列 · 酶 · 特征 · 引物 · 歷史

自定義酶位點，特征，引物，ORF，DNA顏色等的顯示。地圖可以是圓形或線性格式。

2、大序列支持

瀏覽染色體大小序列。

查看 · 搜索 · 縮放

利用SnapGene的高效數(shù)據(jù)處理功能，掃描具有數(shù)千種注釋功能的大型DNA序列。

3、蛋白質(zhì)可視化

查看蛋白質(zhì)序列的多個視圖。

地圖 · 序列 · 屬性 · 特征 · 歷史

自定義區(qū)域，站點，鍵和序列顏色的顯示。

4、直觀的序列編輯

輕松編輯DNA和蛋白質(zhì)序列。

標(biāo)準(zhǔn)編輯 · DNA結(jié)束

進行插入，刪除，替換和大小寫更改。復(fù)制并粘貼序列時，會自動傳輸功能。

5、序列顏色編碼

將選定的DNA或氨基酸序列設(shè)置為十種顏色之一。

給兩條DNA鏈或蛋白質(zhì)序列著色。顏色在Map和Sequence視圖中都可見。

6、特征注釋

自動注釋常用功能，或手動注釋新功能。

自動特征檢測 · 手動特征注釋

使用SnapGene廣泛的數(shù)據(jù)庫查找DNA序列中的常見特征。您選擇的其他功能可以添加到自定義數(shù)據(jù)庫

二、模擬

1、限制性站點指標(biāo)

確認限制性網(wǎng)站適合克隆。

獨特性 · 甲基化***性 · 特殊性質(zhì)

以粗體顯示獨特的限制性位點，或選擇自動定義的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶組。

2、限制性克隆

可視化克隆過程的所有方面。

如果您已經(jīng)考慮過程，則模擬只需幾秒鐘。如果克隆過程存在設(shè)計缺陷，則可以捕獲并糾正錯誤。

3、PCR

模擬標(biāo)準(zhǔn)PCR。

使用您自己的引物，或要求SnapGene自動設(shè)計引物。產(chǎn)品文件在其歷史記錄中存儲模板和引物。

4、重疊延伸PCR

通過重疊延伸PCR融合片段。

最多可組裝八個片段。選擇要連接的片段及其方向，SnapGene將設(shè)計引物。

5、引物定向誘變

使用誘變引物進行定點誘變。

選擇誘變引物，按下按鈕查看修飾的質(zhì)粒。歷史顏色突出了突變。

6、網(wǎng)關(guān)克隆

模擬網(wǎng)關(guān)BP克隆或lr克隆，或兩者在同一時間。

為方便起見，提供了常見的供體向量和目的向量。選擇要組裝的片段，SnapGene將設(shè)計引物。

7、吉布森大會

通過融合多達八個片段或通過將多達八個片段插入向量來模擬Gibson Assembly。Gibson Assembly是一種流行的無縫克隆方法。

選擇要融合的片段及其方向，SnapGene將設(shè)計引物。線性化的載體可以通過酶消化或反向PCR產(chǎn)生。

8、IN-FUSION 克隆

通過在向量中插入最多八個片段來模擬Clontech的In-Fusion克隆。In-Fusion克隆是一種非常通用的方法，可用于創(chuàng)建無縫基因融合。

選擇要融合的片段及其方向，SnapGene將設(shè)計引物。線性化的載體可以通過酶消化或反向PCR產(chǎn)生。

9、TA和GC克隆

通過TA或GC克隆捕獲PCR產(chǎn)物。

選擇傳統(tǒng)的TA克隆或高效GC克隆。

為方便起見，提供了常見的TA克隆載體和Lucigen的GC克隆載體。

10、退火Oligos

退火兩個寡核苷酸形成雙鏈產(chǎn)物。

使用簡單的控件添加突出限制克隆。

三、避免錯誤

1、閱讀基因融合的框架

確保構(gòu)造中的已轉(zhuǎn)換要素符合框架。

鏈接翻譯 · 警告信息使用“序列”視圖可以快速查看兩個已翻譯的要素是否在框架中。如果是這樣，翻譯鏈接在同一行。如果不是，則翻譯在單獨的行上。

2、與參考序列對齊

使用強大的對齊工具檢查實際構(gòu)造是否與模擬構(gòu)造匹配。

四、自動錄制

1、全面的“撤銷”能力幾乎撤消任何操作。

不要害怕嘗試使用SnapGene文件 - 回溯您的步驟很容易。

2、歷史和嵌入式祖先

查看構(gòu)造的圖形歷史記錄。

單擊操作以突出顯示親本和產(chǎn)物序列的相關(guān)部分，或單擊PCR引物名稱以查看引物序列。

單擊歷史記錄樹中的祖先以重新生成該祖先序列文件，包括其注釋和克隆歷史記錄。

3、歷史色彩

使用可選的歷史記錄顏色來標(biāo)識序列的最新更改。

詳細了解構(gòu)建體的組裝方式，包括結(jié)扎的粘性末端。

五、有你的數(shù)據(jù)

1、安全文件管理

將SnapGene文件保存在所需的位置。

使用熟悉的安全操作系統(tǒng)來存儲和整理SnapGene文件。

2、從其他格式導(dǎo)入

閱讀許多常見的文件格式。

不僅可以導(dǎo)入DNA序列，還可以導(dǎo)入注釋和注釋。我們將繼續(xù)開發(fā)進口商，以確保您不會被鎖定為專有文件格式

3、導(dǎo)出為標(biāo)準(zhǔn)格式

將序列，地圖或凝膠圖像轉(zhuǎn)換為標(biāo)準(zhǔn)格式，以便與其他軟件一起使用。

將序列導(dǎo)出為GeNBAnk或FASTA格式。將地圖或模擬瓊脂糖凝膠導(dǎo)出為常見的圖像格式。

4、使用SnapGene Viewer共享數(shù)據(jù)

將SnapGene格式的文件發(fā)送給可以下載免費SnapGene Viewer的同事或客戶。

只需將文件與鏈接一起發(fā)送到SnapGene Viewer即可。收件人將能夠看到地圖，序列和注釋，就像在完整的SnapGene界面中一樣。

六、轉(zhuǎn)換文件格式

開放式信息交換至關(guān)重要，因此SnapGene和SnapGene Viewer提供了讀取和導(dǎo)出常見文件格式的選項。

SnapGene破解版安裝方法

1、在本站下載并解壓，雙擊SnapGene.exe運行，選擇安裝路徑，點擊next

2、許可協(xié)議，點擊i agree

3、現(xiàn)在安裝附件，用戶可以根據(jù)需求安裝；

4、安裝完成，點擊finish即可。

SnapGene破解版使用說明

1、一般技巧

首先，在程序的每一步都要小心。從長遠來看，這種方法可以節(jié)省時間。

確保DNA非常干凈。當(dāng)制備載體或切除待插入的片段時，從約2μg的DNA開始。

每次酶促反應(yīng)后，用旋轉(zhuǎn)柱純化DNA。在40-45μl的10mM Tris（pH8.5）中洗脫DNA，然后進行下一步反應(yīng)。（在用凝膠純化DNA片段之前不需要使用旋轉(zhuǎn)柱。）

為了最大限度地提高效率，請盡量減少程序中的步驟數(shù)。例如，將鈍端片段克隆到鈍性載體位點（例如SmaI位點）比將其用Klenow或T4 DNA聚合酶鈍化的位點更好。

如有疑問，用凝膠純化DNA片段。更清潔的起始材料將產(chǎn)生更好的結(jié)果。

2、準(zhǔn)備矢量

限制性克隆最常見的問題是在手術(shù)后恢復(fù)起始載體。該問題有兩個原因：載體的不完全消化，以及切割載體與其自身的重新連接。下面描述的技巧將最大限度地減少這些影響。

確保載體的消化完成。使用過量的限制酶（約20 U，2μgDNA），消化約4小時。如果載體需要用兩種具有不同最佳反應(yīng)緩沖液的酶切割，則依次進行消化，并在其間進行旋轉(zhuǎn)柱純化。

消化載體（并且如果合適的話鈍化），用磷酸酶處理：在37℃下1小時處于5'突出端，或者如果DNA具有任何平末端或3'突出端則在50℃處理1小時。

用旋轉(zhuǎn)柱除去磷酸酶。通常不需要對載體進行凝膠純化，因為磷酸酶處理會使產(chǎn)生的任何額外DNA片段失活。

3、使用載體

確保消化和磷酸酶反應(yīng)完成。徹底和反復(fù)地渦旋混合物，并且不允許任何液滴逃脫酶處理。在渦旋后短暫旋轉(zhuǎn)以確保管側(cè)沒有留下液滴是個好主意。